今年安卡拉病山东主流行株HEXON部分基因序列

石家庄神九所

    今年安卡拉病山东主流行株HEXON部分基因序列
            2015-12-29
    今将今年山东流行的安卡拉病毒的HEXON蛋白基因的部分序列公布，该序列已上传至美国NCBI基因库上，已获授权登陆号为kt999720，因为公众看到仍需要等待一段时间，所以今全文公布 ，以供同行、朋友、专家审核，并批评指导。从目前信息来年，神九所有可能是2015年中国第一个公布此病毒基因序列的。

LOCUS       Seq1                    1128 bp    DNA    linear   VRT 03-NOV-2015

DEFINITION hexon protein gene, partial cds.

ACCESSION  Seq1

VERSION

KEYWORDS   .

SOURCE     Gallus gallus (chicken)

ORGANISM  Gallus gallus

           Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;

           Archelosauria; Archosauria; Dinosauria; Saurischia; Theropoda;

           Coelurosauria; Aves; Neognathae; Galloanserae; Galliformes;

           Phasianidae; Phasianinae; Gallus.

REFERENCE  1  (bases 1 to 1128)

AUTHORS   Zhu,w., Wang,h., Liu,h.,Liu,j., Wang,y., Wang,c., Xu,l., Gao,y.

           and Song,q.

TITLE     Fowl aviadenovirus 4isolate from ShanDong,hexonprotein

           gene,partial cds

JOURNAL   Unpublished

REFERENCE  2  (bases 1 to 1128)

AUTHORS   Zhu,w., Wang,h., Liu,h.,Liu,j., Wang,y., Wang,c., Xu,l., Gao,y.

           and Song,q.

TITLE     Direct Submission

JOURNAL   Submitted (04-NOV-2015) Shijiazhuang SHENJIU Animal and Poultry

            Disease Institute, Institute, ShiJiaZhuang heping West Road No.

           598, ShiJiaZhuang, HeBei050000, China

COMMENT    Bankit Comment: TOTAL # OF SEQS:1.

           

           ##Assembly-Data-START##

           Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing

           ##Assembly-Data-END##

FEATURES             Location/Qualifiers

    source          1..1128

                    /organism="Gallusgallus"

                     /proviral

                     /mol_type="genomicDNA"

                     /isolate="liver"

                     /host="chicken"

                    /db_xref="taxon:9031"

                     /country="China"

                    /collection_date="2015"

    CDS             1..>1128

                     /note="Fowlaviadenovirus 4"

                     /codon_start=1

                     /product="hexon"

                    /translation="TRAVLQPYCGTAYNPLAPKESMFNNWSETAPGQNVSASGQLSNV

                    YTNTSTSKDTTAAQVTKISGVFPNPNQGPGRNPLRRVQNANTGVLGRFAKSQYNYAYG

                    AYVKPVAADGSQSLTQTPYWIMDNTGTNYLGAVAVEDYTNSLSYPDTIVVPPPEDYDD

                    YNIGTTRALRPNYIGFRDNFINLLYHDSGVCSGTLNSERSGMNVVVELPDRNTELSYQ

                    YMLADMMSRHHYFALWNQAVDQYDPEVRVFSNDGYEEGAPSYAFNPEAVGAGEGYGPD

                    LSQIKLYTNNTAANDKNTAVANATTNFYFGTVPSYEIDISATQRRNFIMANIAEYLPD

                    RYKFSISGFDATSVAPTTYEYMNKRVPLTNVVDMSRTWCAVG"

BASE COUNT      262 a   388 c    283 g    195 t

ORIGIN     

       1 acgagggccg tccttcagcc ctactgcggc acggcttaca acccgctggc tcccaaggag

      61 tccatgttta acaactggtc ggagacggca cccgggcaga acgtgtccgc ctccggtcag

     121 ctgtccaacg tctataccaa cacgagcacc tccaaagaca cgacggcggc gcaggtgacg

     181 aagatttccg gcgtcttccc caatcccaac cagggacccg gaagaaatcc tctgcgacgg

     241 gtacaaaacg ccaacaccgg cgtgctcggt cgcttcgcca agtctcagta caattacgct

     301 tacggtgcct acgtcaagcc cgtcgccgcc gacggttccc agtccctcac gcagaccccc

     361 tactggatca tggataacac gggcaccaat tacctgggag cggtggccgt cgaggactac

     421 accaacagcc tctcgtaccc agataccata gtcgtgccgc ctcccgagga ctacgacgat

     481 tataacatag gcaccacgcg tgcgctcagg cccaactaca tcgggttcag ggataacttc

     541 attaacctgc tgtatcacga ctccggcgtg tgctcgggca ccctcaactc ggagcgttcg

     601 ggcatgaacg tggtggtcga gctgcccgac cggaataccg agctcagcta ccagtacatg

     661 ctggccgaca tgatgtcccg ccatcactat ttcgccctgt ggaaccaggc cgtggaccag

     721 tacgaccccg aggtgcgagt cttctccaat gacggttacg aagaaggcgc gcccagctac

     781 gccttcaacc ccgaagcggt aggcgcggga gaaggctacg gccccgatct cagtcaaatt

     841 aaactctaca ccaacaacac cgccgcgaac gacaaaaaca ccgccgtggc taacgccact

     901 accaacttct acttcggcac ggtaccctcc tacgaaatcg atatcagcgc tacccagagg

      961 cgcaacttta tcatggccaa catcgccgagtatctgcccg accgttacaa gtttagcatc

    1021 tccggcttcg acgccaccag cgtcgcgcct accacctacg agtacatgaa caagcgcgtc

    1081 cccctcacca acgtcgtcga catgtcacga acgtggtgcg cggtgggg

知足常乐

俺确实看不懂，不过还是顶一下，神九威武

正方形

感觉安卡拉越来越近了。

共享精神

正方形 发表于 2015-12-29 11:34
感觉安卡拉越来越近了。

不怕不怕，有抗体了。已经不像一开始那么令人慌张无措了！

正方形

共享精神 发表于 2015-12-29 12:55
不怕不怕，有抗体了。已经不像一开始那么令人慌张无措了！

本来就赚不了几个钱，再加上抗体，费钱费事的。日子真的不好混。