“京芯一号mini”芯片+数字化肉鸡联合育种平台——我国肉鸡育种产业新的里程碑

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在现代农业科技的浪潮中，育种技术的创新已成为推动产业升级的关键力量。8月20日，我们要介绍的是由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所与北京康普森生物技术有限公司联合推出的两大育种利器——“京芯一号mini”芯片和数字化肉鸡联合育种平台。这两项技术的联袂登场，预示着我国肉鸡育种产业即将迎来一个新的里程碑。

“京芯一号”的诞生可以追溯到我国肉鸡育种的创新进程。2017年，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所与北京康普森生物技术有限公司共同研发了国内首款自主肉鸡育种SNP芯片——京芯一号55K。

基于“京芯一号”的肉鸡基因组选择技术至今已应用于多家国家级核心育种场，累积检测样本超15万，该芯片的应用加速了我国自主培育白羽肉鸡“广明2号”、黄羽肉鸡“金陵黑凤鸡”、“潭牛文昌鸡”等品种的育成，为打好种业翻身仗提供坚实的技术支撑。然而，随着育种企业对降低成本和提升效率的需求日益迫切，京芯一号mini应运而生。



芯片特点

“京芯一号mini”是基于“京芯一号”55K芯片的位点降维版本，它保留了在不同商业化黄羽、白羽肉鸡的高质量位点，以及与饲料报酬、生长、肉质、胴体、繁殖和抗病等功能位点，与京芯一号55K可以通过填充技术无缝衔接，可应用于基因组选择、亲缘关系判定、遗传多样性评估等工作，实现了遗传评估的高准确性的同时，将基因检测成本降低了40%以上。



芯片应用情况-产品性能

京芯一号mini在不同品系位点多态性表现优异，样本检测率可达99.8%。





芯片应用情况-填充及遗传评估效果

京芯一号mini芯片与京芯一号55K联合使用，不同品系参考面板数量达1000样本时，填充准确性可达98.5%，同时京芯一号mini填充到京芯一号55K芯片进行育种值评估与直接应用京芯一号55K芯片各性状育种值相关性可达99.5%以上。







与“京芯一号mini”相辅相成的是数字化肉鸡联合育种平台。该平台融合了尖端信息技术、计算机科学、数量遗传学和基因组学的最新成果，实现了数据的智能整合、多条件数据质控、多维度个体追踪和精准核心表型提取功能。在开发技术上平台基于Spring Boot框架，采用B/S架构和MySQL数据库技术，将现有基因组选择工作中的样本采集、生产管理、育种管理等环节进行深入融合，实现了企业数据全链条规范管理、多任务协调处理、一键化遗传评估的功能，进一步推进了育种企业的信息化进度。



“京芯一号mini”与数字化肉鸡联合育种平台的结合使用，企业前期使用京芯一号55K芯片构建GS参考群的同时构建填充面板，后续基于联合育种平台用户可以根据自己的育种需求，选择合适的分析模型，并依托全自动化育种评估模块对京芯一号mini芯片检测的候选群进行育种值评估，快速生成详尽的评估报告，极大提高了育种工作的效率。


注：为保证参考面板的准确性，选入核心群的个体再进行京芯一号55K芯片补测，可大大降低候选群基因检测成本。



随着“京芯一号mini”与数字化肉鸡联合育种平台的推出，我们相信，我国肉鸡育种产业将迎来更加广阔的发展前景。这两项技术的结合，不仅将加速新品种的培育，也将为我国肉鸡种业的国际竞争力供坚实的技术支撑。



中国农业科学院北京畜牧兽医研究所鸡遗传育种创新团队，专注肉鸡育种 30 年，以解决产业“两只鸡：一只保供给的白鸡、一只保品质的黄鸡”的核心种源为己任，围绕肉鸡“节粮、品质、抗病”三大核心问题，以遗传机理解析、高效育种技术研发、新品种培育为主线，系统开展肉鸡育种关键技术研发和应用。发明“京芯一号”肉鸡育种芯片，建立大数据基因组育种技术体系，并在国家级核心育种场广泛应用，培育广明2号白羽肉鸡、京星系列黄羽肉鸡、金陵系列黄羽肉鸡等核心品种 7 个，先后获国家科技进步二等奖 2 项，北京市科技进步一等奖1项，发表论文300余篇，获发明专利 20 余项，成果高效转化，经济和社会效益显著。

来源：中国畜禽种业