今年安卡拉病山东主流行株HEXON部分基因序列
今年安卡拉病山东主流行株HEXON部分基因序列2015-12-29
今将今年山东流行的安卡拉病毒的HEXON蛋白基因的部分序列公布，该序列已上传至美国NCBI基因库上，已获授权登陆号为kt999720，因为公众看到仍需要等待一段时间，所以今全文公布 ，以供同行、朋友、专家审核，并批评指导。从目前信息来年，神九所有可能是2015年中国第一个公布此病毒基因序列的。
LOCUS Seq1 1128 bp DNA linear VRT 03-NOV-2015
DEFINITION hexon protein gene, partial cds.
ACCESSIONSeq1
VERSION
KEYWORDS .
SOURCE Gallus gallus (chicken)
ORGANISMGallus gallus
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Archelosauria; Archosauria; Dinosauria; Saurischia; Theropoda;
Coelurosauria; Aves; Neognathae; Galloanserae; Galliformes;
Phasianidae; Phasianinae; Gallus.
REFERENCE1(bases 1 to 1128)
AUTHORS Zhu,w., Wang,h., Liu,h.,Liu,j., Wang,y., Wang,c., Xu,l., Gao,y.
and Song,q.
TITLE Fowl aviadenovirus 4isolate from ShanDong,hexonprotein
gene,partial cds
JOURNAL Unpublished
REFERENCE2(bases 1 to 1128)
AUTHORS Zhu,w., Wang,h., Liu,h.,Liu,j., Wang,y., Wang,c., Xu,l., Gao,y.
and Song,q.
TITLE Direct Submission
JOURNAL Submitted (04-NOV-2015) Shijiazhuang SHENJIU Animal and Poultry
Disease Institute, Institute, ShiJiaZhuang heping West Road No.
598, ShiJiaZhuang, HeBei050000, China
COMMENT Bankit Comment: TOTAL # OF SEQS:1.
##Assembly-Data-START##
Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing
##Assembly-Data-END##
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..1128
/organism="Gallusgallus"
/proviral
/mol_type="genomicDNA"
/isolate="liver"
/host="chicken"
/db_xref="taxon:9031"
/country="China"
/collection_date="2015"
CDS 1..>1128
/note="Fowlaviadenovirus 4"
/codon_start=1
/product="hexon"
/translation="TRAVLQPYCGTAYNPLAPKESMFNNWSETAPGQNVSASGQLSNV
YTNTSTSKDTTAAQVTKISGVFPNPNQGPGRNPLRRVQNANTGVLGRFAKSQYNYAYG
AYVKPVAADGSQSLTQTPYWIMDNTGTNYLGAVAVEDYTNSLSYPDTIVVPPPEDYDD
YNIGTTRALRPNYIGFRDNFINLLYHDSGVCSGTLNSERSGMNVVVELPDRNTELSYQ
YMLADMMSRHHYFALWNQAVDQYDPEVRVFSNDGYEEGAPSYAFNPEAVGAGEGYGPD
LSQIKLYTNNTAANDKNTAVANATTNFYFGTVPSYEIDISATQRRNFIMANIAEYLPD
RYKFSISGFDATSVAPTTYEYMNKRVPLTNVVDMSRTWCAVG"
BASE COUNT 262 a 388 c 283 g 195 t
ORIGIN
1 acgagggccg tccttcagcc ctactgcggc acggcttaca acccgctggc tcccaaggag
61 tccatgttta acaactggtc ggagacggca cccgggcaga acgtgtccgc ctccggtcag
121 ctgtccaacg tctataccaa cacgagcacc tccaaagaca cgacggcggc gcaggtgacg
181 aagatttccg gcgtcttccc caatcccaac cagggacccg gaagaaatcc tctgcgacgg
241 gtacaaaacg ccaacaccgg cgtgctcggt cgcttcgcca agtctcagta caattacgct
301 tacggtgcct acgtcaagcc cgtcgccgcc gacggttccc agtccctcac gcagaccccc
361 tactggatca tggataacac gggcaccaat tacctgggag cggtggccgt cgaggactac
421 accaacagcc tctcgtaccc agataccata gtcgtgccgc ctcccgagga ctacgacgat
481 tataacatag gcaccacgcg tgcgctcagg cccaactaca tcgggttcag ggataacttc
541 attaacctgc tgtatcacga ctccggcgtg tgctcgggca ccctcaactc ggagcgttcg
601 ggcatgaacg tggtggtcga gctgcccgac cggaataccg agctcagcta ccagtacatg
661 ctggccgaca tgatgtcccg ccatcactat ttcgccctgt ggaaccaggc cgtggaccag
721 tacgaccccg aggtgcgagt cttctccaat gacggttacg aagaaggcgc gcccagctac
781 gccttcaacc ccgaagcggt aggcgcggga gaaggctacg gccccgatct cagtcaaatt
841 aaactctaca ccaacaacac cgccgcgaac gacaaaaaca ccgccgtggc taacgccact
901 accaacttct acttcggcac ggtaccctcc tacgaaatcg atatcagcgc tacccagagg
961 cgcaacttta tcatggccaa catcgccgagtatctgcccg accgttacaa gtttagcatc
1021 tccggcttcg acgccaccag cgtcgcgcct accacctacg agtacatgaa caagcgcgtc
1081 cccctcacca acgtcgtcga catgtcacga acgtggtgcg cggtgggg
本帖最后由 知足常乐 于 2015-12-29 11:10 编辑
俺确实看不懂，不过还是顶一下，神九威武 感觉安卡拉越来越近了。 正方形 发表于 2015-12-29 11:34
感觉安卡拉越来越近了。
不怕不怕，有抗体了。已经不像一开始那么令人慌张无措了！ 共享精神 发表于 2015-12-29 12:55
不怕不怕，有抗体了。已经不像一开始那么令人慌张无措了！
本来就赚不了几个钱，再加上抗体，费钱费事的。日子真的不好混。:'(:'(
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