【分享】禽传染性支气管炎病毒的毒株多样性和全球分布-续

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简介

全球粮食安全危机背景下，家禽业面临挑战。传染性支气管炎是最重要的病毒感染之一，给全世界家禽业造成巨大的经济损失。其病原体传染性支气管炎病毒（IBV）是一种RNA病毒，具有很强的突变和重组能力；因此，能够产生难以控制的新病毒株。全世界发现了许多 IBV 毒株，包括马萨诸塞州、4/91、D274 和 QX 样毒株，这些毒株可分为经典或变异血清型。目前，关于IBV的流行病学、毒株多样性和全球分布等信息尚未得到全面报道。这篇综述是对世界各地发现的IBV毒株的分布、遗传关系和多样性的最新知识的更新。

5、中东地区

中东地区 IBV 菌株和疾病的流行情况因国家而异。中东首次报道了类似中国的重组病毒（DY12-2-like）（Seger等，2016）。

5.1伊朗

来自伊朗的初步报告表明，Mass 样 IBV 是最常见的分离血清型（12 个分离株），其次是欧洲 D274 和 4/91 (793/B) 样毒株（3/2001和14/2001）随后，研究表明，4/91 样血清型在肉鸡中比 Mass 型血清型更为普遍。1999 年至 2004 年间，对 150 只鸡群进行了 IBV 变种检测，其中 57 只（52.7%）鸡群 793/B 血清型呈阳性，18 只（16.6%）鸡群 Mass 型 IBV 阳性，而 33 只（30.5%）鸡群双重感染这两种病毒基因型。随后有人提出，目前使用的 Mass 和 4/91 血清型疫苗不能充分保护鸡免受 IBV 感染；

事实上，这些疫苗甚至可能使病毒流行病学变得复杂。伊朗 IRFIBV32 变种，793/B 或 CR88 样血清型，具有广泛的组织分布，导致呼吸、泌尿生殖和消化系统明显病变。正如在接种伊朗 IR/773/2001 后观察到的，这些病毒株还表现出对法氏囊的趋向性。这表明 IRFIBV32 变体具有免疫抑制潜力。伊朗IBV分离株还通过S1基因测序进行了表征，然后将这些分离株分为六个不同的系统发育簇；即，IS/1494/06 (Var2) 类、4/91 类、QX 类、IS/720 类、Mass 类和 IR-1 (3%)，隔离率为 32、21、分别为 10%、8%、4% 和 3%（Najafi等人，2016）。

5.2伊拉克

4/91 IBV 血清型在伊拉克苏莱马尼流行。有针对该血清型以及 Ma5 和 H120 血清型的疫苗。一种新的 IBV 变种 Sul/01/09 在伊拉克肉鸡养殖场也很流行，这种变种与伊拉克和邻国报道的疫苗和其他血清型不同（Mahmood 等人，2011）。最近，2014 年至 2015 年间，据报告伊拉克有四个主要群体：即，I组：变体2[IS/1494样]，II组：793/B样，III组：QX样，IV组：DY12-2样基因型。I、II 和 III 组内的核苷酸序列同一性分别为 96.42-100、99.68-100 和 99.36-100%。I 组（变体 2）是伊拉克最常见的分离IBV。

5.3约旦

在约旦发现的 IBV 毒株包括 Ark、DE-072 和 Mass（。后来检测到的其他 IBV 变种有 4/91 和 D274；然而，使用现有的 IBV 引物无法扩增另外两种变体。使用血清型特异性抗血清，在临床健康鸡群中检测到 M41、4/91 和 D274 抗体。最近，还鉴定了五种 QX 样 IBV，分别命名为 JOA2、JOA4、沙特阿拉伯样 [Saudi-1、Saudi-2] 和伊拉克样菌株。系统发育分析显示，5个IBV分离株与中国QX样毒株CK/CH/LDL/97I有96.6-99.1%的相关性，并且与M41和H120疫苗血清型的核苷酸相似性<80%。CK/CH/LDL/97 菌株被认为与中东地区的散发性 IB 疫情有关。据推测，中东国家新IBV毒株的出现是减毒活疫苗病毒与野外毒株重组的结果（Ababneh等人，2012）。

5.4以色列

在以色列，与之前的报告类似，发现了 13 种新的 IBV 变种（Abdel-Moneim等人，2006）。其中，11 个与之前报道的以色列变种菌株 IS/885 和 IS/1494/06 密切相关，两个分离株与欧洲 CR/88121 和/或 4/91 菌株聚集在一起（Selim 等人，2013）。

6、印度、巴基斯坦和孟加拉国

孟加拉国有IBV 的血清学证据（Das等人，2009），印度（Sarma等人，1984）和巴基斯坦（Ahmed等人2007）。在巴基斯坦，根据抗体滴度，流行的 IBV 变种为 M41、D-274、D-1466 和 4-91。最近，对印度西部的一种新的肾病性IBV变种PDRC/Pune/Ind/1/00进行了分子鉴定。这种变异是从表现出内脏痛风和严重肾病等临床症状的商业肉鸡中分离出来的（Bayry等人，2005）。尽管IB疫苗在这些国家使用，但它们对当地菌株的有效性尚未得到评估（de Wit等人，2011a）。

7、澳大利亚和新西兰

大多数澳大利亚 IBV 菌株具有肾病原性，只有少数会引起呼吸道疾病。肾病致病菌株特别令人感兴趣，因为这些分离株会导致鸡的临床肾炎和死亡（Ignjatovic等人，2002）。澳大利亚有两个成熟且不同的 IBV 团体。第 1 组包括 Vic S、V5/90、N1/62、N3/62、N9/74 和 N2/75，它们之间的氨基酸序列相似性为 80.7-98.3%。其中，只有 Vic S、N1/62、N9/74 和 N2/75 会导致呼吸系统和肾脏相关疾病。N1/62、N9/74 和 N2/75 的实验感染导致 32-96% 的死亡率。第 2 组分离株包括 N1/88、Q3/88 和 V18/91，它们会引起呼吸道症状，但不会导致死亡。最近，第三组被添加到流行的IBV 列表中。第三组的代表，Chicken/Australia/N2/04，与第一组和第二组的菌株只有轻微的同源性。该变体分别与来自荷兰和美国的D1466和DE072菌株密切相关。肾病性 IBV 毒株被称为“T”毒株，例如澳大利亚常见的 T 毒株 (N1/62)，会导致受感染禽类的肾脏损伤和 5-90% 的死亡率。

四种血清学独特的 IBV 血清型 A、B、C 和 D 于 1967 年在新西兰首次报道（Pohl，参考波尔1967 年；乙脑。参考劳尔1988）。针对 A 血清型开发的疫苗被证明可以针对所有四种血清型提供保护，因此已在该国用于控制 IB。最近，鉴定出与 C 和 D 株相似的 T6、K43 和 K87 分离株，以及与 B 株相似的 K32 分离株（McFarlane 和 Verma，参考麦克法兰和维尔玛2008）。

8、俄罗斯及周边国家

俄罗斯 IBV 分离株主要为 Mass 血清型，但也有一些分离株与欧洲起源的 D274、4/91、B1648、624/I 和 It-02 基因型有关。在与俄罗斯、远东和欧洲接壤的地区报告了两种新的类似 QX 的分离株。在这些分离株中，27 种是独特的俄罗斯变种，与已知的 IBV 毒株不同（Bochkov等人，2006）。2007 年至 2010 年间，对俄罗斯、乌克兰和哈萨克斯坦等地区的 IB 进行了广泛的流行病学研究，结果表明，IBV 的动态已随 Mass、793/B、D274 和 QX 样 IBV 的变化而变化，现已成为最流行的基因型，其次是 B1648、Italy-02 和 Arkansas 变种。报告了 11 种 4/91 相关 IBV 分离株，其中包括现场和疫苗毒株的重组体以及指定为 UKR/02/2009（或 4/91）、RF/03/2010 和 RF/01/2010 的本地毒株（奥夫钦尼科娃等人，2011）。

9、欧洲

IBV 变种分离株于20 世纪 70 年代初在欧洲首次报道（Dawson 和 Gough，参考道森和高夫1971）。后来，荷兰多恩研究所从大规模分离疫苗接种的鸡群中分离出四种血清型，分别命名为 D207（也称为 D274）、D212（也称为 D1466）、D3896 和 D3128。在英国，793/B（也称为 4/91 和/或 CR88）被确定为主要血清型。在英国也鉴定出了 Mass IBV 基因型的其他欧洲血清型。然而，在欧洲血清型中，793/B（也称为 4/91 和 CR88）和 D274 仍然受到国际关注，因为它们有在欧洲内外传播的倾向。

一项确定西欧 IBV 变异的研究表明，793B 血清型占主导地位，其次是 Mass 型、H120、M41、IBM、Italy02 以及与中国 QX 分离株密切相关的变异（Worthington 等人，2008）。值得注意的是，类似 QX 的 IBV 于 2004 年在欧洲首次分离出来，最近已成为欧洲最具挑战性的 IBV。尽管在中国，这种分离株最初被认为会引起轻度腺胃炎，在欧洲，其趋向性已改为肾脏和输卵管。苏格兰已报道了 QX 样 IBV 血清型。

10、亚洲

据推测，IBV 毒株在亚洲早已存在。这种推测是基于该地区发现的各种分离株的系统发育多样性（Yu等人，2001）。在这些国家中，中国出现了几种不同的IBV变种。尤其是 QX 菌株，已传播到世界其他地区，包括欧洲、中东和非洲。该毒株是IBV基因发生显着改变的结果，目前尚无有效疫苗可控制该病毒变种的感染（沃辛顿等人,参考2008）。

10.1 马来西亚和新加坡

马来西亚于 1967 年首次记录了 IBV 感染病例。20 世纪 90 年代之前分离的大多数 IBV 与 Mass 血清型疫苗株病毒（Arshad，1993）。随后的研究确定了两种独特的IBV变种，分别于1995年和2004年分离的肾病致病株MH5365/95和呼吸道致病株V9/04。这些变体后来被证明与几个中国分离株具有显着的相似性（Zulperi等人，2009）。

新加坡也遭受IB感染。根据其抗原相关性，大多数已鉴定的血清型被分类为类群血清型（Yu等人，2001）。

10.2 泰国

20 世纪 60 年代初，泰国开始爆发 IBV 感染。对 2008 年在泰国分离的 13 个样本进行的序列分析揭示了两个 IBV 群体。第 1 组分离株 THA20151、THA40151、THA50151 和 THA60151 是泰国特有的，第 2 组分离株 THA30151、THA 70151、THA 80151、THA100151、THA110351、THA120351、THA130551 和 THA140551 ，有 97–98% 和 96–与中国流行的QX A2、SH和QXIBV血清型的核苷酸和氨基酸序列同一性分别为98%。一种减毒疫苗是从泰国 QX 样 THA80151IBV 分离株中开发出来的，尽管有证据表明病毒复制以及气管和肾脏出现病理病变，但该疫苗仍能预防临床疾病（Sasipreeyajan 等人，2012）。

10.3 印度尼西亚

在印度尼西亚，IBV 在 20 世纪 70 年代首次被描述（Ronohardjo，1977）。根据抗原特征，印度尼西亚分离株 I-37 与美国原产的 Conn 46 株发生交叉反应；三个分离株 I-269、I-624 和 PTS-II 与 Mass 41 疫苗株发生交叉反应，而两个分离株 I-625 和 PTS-III 与澳大利亚 N2/62 株相关（Darminto，1995 ） ; 因德里阿尼,参考因德里阿尼2000）。对 I-37 分离株的进一步分析显示，与 Conn-46 分离株在核苷酸和氨基酸序列上分别存在约 6.9% 和 15.6% 的差异。因此，I-37 被认为是 Conn 46 血清型的变体，可能是由疫苗-病毒重组事件产生的。两个分离株之间是否存在任何功能和/或基因组差异尚待确定（Dharmayanti等人，2005）。

10.4 韩国

韩国的大多数 IBV 变种属于肾病致病型，分为 KM91 样、QX 样或重组株（Song等人，1998年；张等人,2011）。最近对分离的 27 个 IBV 变种的分析将韩国 IBV 分离株分为五种基因型：(i) 大众疫苗血清型，(ii) 韩国 I (KI)，(iii) 中国 QX 株相关，(iv) ) KM91 样分离株，以及 (v) 不属于任何已知韩国菌株组的分离株。两种基因型 11036 和 11052 似乎分别是由簇 1 中的新韩国基因型与中国 QX 样毒株之间以及 KI 与 H120 疫苗血清型之间的重组事件产生的（Mo 等人，2013）。

10.5 日本

在日本，IBV 变种与 Gray 和 Mass 分离株共存（Mase等人，2004）。本地变种表现出与现有分离株不同的聚类模式，但与中国和台湾省的分离株密切相关。来自未接种疫苗鸡群的本地分离株，例如 JP/Wakayama/2003、JP/Iwate/2005 和 JP/Saitama/2006，与 4/91 变种具有相同的特征，可能源自法国或西班牙。另一方面，从 4/91 接种疫苗的鸡群中分离出的一种日本变种 JP/Wakayama-2/2004 与疫苗株有关（Mase 等人2008年；岛崎等人,2009）。

10.6 中国

在中国，IBV首次报道于20世纪80年代中期。为了控制该国鸡的 IBV 感染，使用了源自 Mass（H120 和 Ma5）和 Conn 血清型的减毒活疫苗和灭活油佐剂疫苗。然而，这些疫苗只能减少而不是根除这个问题，因为这种疾病仍然是家禽业的主要治疗手段（Han 等人2011）。中国的IBV表现出极大的多样性，尽管该国报告了几种 Mass 和 4/91 样分离株。还分离出 QX 和 LX 样 IBV 株，它们与已知的疫苗血清型不同（Yudong等人，1998年；赵等人,2017），这些毒株大致分为 A2 样毒株和 QX-IBV 毒株（Xu等人，2007年；邹等人,2010年；李等人,2013）。

10.7中国台湾

在台湾省，IBV 在 20 世纪 60 年代初首次被描述为 Mass 疫苗血清型的分离株。大多数本地 IBV 变种与中国毒株归为一类（Huang 和 Wang，2006）。台湾省 IBV 毒株，称为台湾 II，与 TW2296/95 血清型密切相关，该血清型也在中国大陆分离到（Ma等人，2012）。

结论

很明显，IBV 已成为全球流行病。新的 IBV 变种不断出现，引起了家禽业的高度关注。这些新病毒变种对目前使用的现有疫苗没有反应。尽管某些基因型仅限于某些地理区域，但其他基因型，例如 Mass、IBV 4/91（CR88 或 7/91B）以及最近出现的 QX 样 IBV 的分布更为全球性。因此，可以考虑将这些全球基因型用于开发新型多价通用疫苗。然而，除了基于普遍存在的基因型的通用疫苗外，还可以采用基于特定当地毒株的区域疫苗接种策略。

来源：鸡保姆，作者：法鲁库·班德等