治疗肠毒综合征第一要务是治疗球虫，用磺胺药才是正确的选择，使用地克珠利和妥曲珠利治疗往往效果不明显。此外白头翁口服液的清热解毒、燥湿凉血的功效显著，因此，它对于沙门氏菌引起的鸡白痢，大肠杆菌所引起的肠炎腹泻等都有很好的疗效。黄芪不但能够固本，同时对肠道还有很好的作用。
　　1　轻症肠毒综合征，球虫轻微感染
　　白头翁口服液(150千克水/瓶)+治疗球虫药物(磺胺氯吡嗪钠可溶性粉)，连用3天。
　　2　重症肠毒综合征，球虫感染较严重
　　磺胺氯吡嗪钠可溶性粉+白头翁口服液+黄芪多糖(100千克水/瓶)+硫酸新霉素的复方制剂，连用3天，治疗后，用益生菌制剂，连用5天。调理肠道，修复肠道粘膜，加快康复，防止复发。