我国科学家揭示非洲猪瘟病毒DNA连接酶的分子机制
该研究用X-射线晶体学方法解析了AsfvDNAL与不同类型DNA复合物的结构,揭示了AsfvDNAL结合和催化底物连接的分子机制,为针对非洲猪瘟病毒DNA修复通路蛋白的药物设计提供了结构基础。http://down.jbzyw.com/attchment/forum/201901/28/144216udg32p44g9sdor4i.png.thumb.jpg
图1. AsfvDNAL与DNA底物复合物的晶体结构
ASFV病毒编码了多个蛋白,形成了一套完整的DNA修复通路。与通常的DNA修复通路不同,ASFV DNA修复通路中的DNA 聚合酶(AsfvPolX)和连接酶(AsfvDNAL)的保真性都非常低,在ASFV病毒基因组的修复和突变过程中均发挥了关键作用。本团队早期研究发现,AsfvPolX拥有一个独特的磷酸根识别位点,对其底物结合和催化活性十分关键(Plos Biology, 2017)。
本文主要讨论了AsfvDNAL。AsfvLIG由419个氨基酸组成,是迄今发现的最小的DNA连接酶之一,并且是迄今为止发现的最易出错的连接酶之一,它催化ASFV DNA修复过程中的DNA连接反应,在病毒基因组的诱变中起着重要作用。AsfvLIG在中心有一个腺苷化结构域(AD),在C端有一个OB折叠结构域(OB);AD和OB结构域在同源蛋白中都是保守的。除了AD和OB结构域外,许多DNA连接酶都有一个DNA结合域(DBD),这对于底物结合和连接过程至关重要,而AsfvLIG的N端区域(NTD)与其他连接酶DBD结构域没有相似之处。
AsfvLIG包含四个独特的残基,包括AD域的Asn 153和Leu 211,以及OB结构域的Leu 402和Gln 403。虽然他们不参与直接催化过程,这些残基可能与其相应的NTD或DBD结构域协同工作,这些位点残基对缺口的识别和催化效率有着重要的意义。
该文章发现的4种独特的结构特征可以作为小分子设计的潜在靶点,这可能会损害ASFV的基因组修复,并有助于今后对抗这种病毒。
来源:综合农业农村部、iNature整理
太慢了。
加强研究迎难而上! 再搞不出疫苗养猪业会垮掉的 谢谢分享
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